一般土壤中，這兩個均可使用。但在鹽漬土、海濱土或酸性和含硫酸根離子較高的環境中，宜采用含鉻高硅鑄鐵陽極。如果是高電阻率的土壤，使用高硅鑄鐵深井陽極時，可通過加深陽極埋設深度來降低接地電阻，而柔性陽極在高電阻率環境中也能較好地工作，因其可通過增加長度等方式來改善電流分布。不過，柔性陽極不宜在含油污水和鹽水中使用。
地表空間狹小時，如城市密集管網區域，可采用高硅鑄鐵深井陽極，能減小對其他金屬構筑物的干擾且節約用地。對于形狀復雜、空間狹窄的區域，如儲罐底部、老舊管道周圍等，柔性陽極更具優勢，因其柔韌性好，能適應各種形狀和大小的被保護物體。
高硅鑄鐵深井陽極適用于遠離居民區和其他重要設施的場所，因為其安裝和運行過程中可能會對周圍環境產生一定的干擾。而柔性陽極對其他裝置的干擾非常小，可用于靠近居民區或有其他敏感設施的區域。
被保護對象：
對于大型長輸管線、城市管網等，高硅鑄鐵深井陽極輸出電流大，能滿足長距離管道的保護需求。對于覆蓋層質量較差的管道及位于復雜管網或多地下金屬構筑物區域內的管道，柔性陽極更合適，可解決電流分布不均勻和對其他結構物的干擾問題。
儲罐底部的陰極保護，柔性陽極能更好地實現電位均勻分布，避免保護不足或過保護的問題。高硅鑄鐵深井陽極一般較少單獨用于儲罐底部保護，通常作為輔助陽極與其他陽極配合使用。
安裝施工：
高硅鑄鐵深井陽極安裝需要專業設備和施工工藝來挖掘深井，施工相對復雜，成本較高。柔性陽極安裝簡便，類似電纜鋪設，可根據現場情況靈活鋪設，施工成本相對較低。
高硅鑄鐵深井陽極與被保護管道等的連接相對復雜，需要確保良好的電氣連接和絕緣性能。柔性陽極與被保護體的連接較為簡單，可通過專用的連接裝置實現可靠連接。
電氣性能：
高硅鑄鐵深井陽極輸出電流大，單支陽極輸出電流一般不超過 2A，可滿足大型結構物的保護需求。柔性陽極輸出電流相對較小，但其能根據被保護體的形狀和尺寸進行靈活布置，以達到較好的保護效果。
高硅鑄鐵深井陽極距離被保護金屬有一定距離，電流分布較均勻，但在被保護體沿線的電位均勻性上稍差。柔性陽極電位分布最為均衡，能有效避免保護不足和過保護的問題。
使用壽命和成本：
高硅鑄鐵深井陽極和柔性陽極的使用壽命都較長，一般可達 20 年甚至更長，具體取決于陽極材料的質量、土壤環境等因素。不過高硅鑄鐵深井陽極在某些惡劣環境下可能會因保護膜被破壞而影響使用壽命。
高硅鑄鐵深井陽極材料成本相對較低，但安裝成本高；柔性陽極材料成本較高，但安裝簡便可減少施工成本。
高硅鑄鐵深井陽極在運行過程中需要定期檢查深井的狀況、陽極的腐蝕情況以及導氣管的暢通性等。柔性陽極則需要檢查其表面是否有破損、與被保護體的連接是否良好等。相對來說，柔性陽極的維護更簡單一些。