用戶選擇凈水器，有三個基本數據應該明確：即原水水質、目標水質（處理后水質）及水處理量。特別是原水水質要求越詳細越好，最好是有化驗數據，這樣可以進行有針對性的設計，選擇更為合適的工藝及設備，達到更好的水處理效果。需要說明的是要達到目標水質，往往不是一臺凈水設備處理效果能達到的，有時需要一整套工藝流程，多臺凈水設備串聯或并聯運行，才能達到需要的水質或水量要求。以下凈水器選擇方法供參考：
如果沒有接通水廠自來水，準備擬建自備水廠，需要把自然水源（地下水源或地表水源）凈化成飲用水（自來水）的，根據水源情況選用我公司地下水處理設備，地表水處理設備，小水量的可選用小型家用類凈水器。以上設備也可以用于凈化原水，降低原水濁度，達到使用清水或水循環使用的場所。
地下水處理設備有重力式、壓力式及自凈壓力式，重力式設備產水重力自流至清水池，要求設備頂部高于清水池頂2.5米以上，設備配反洗泵沖洗（或用供水泵反洗）。壓力式需有壓力氣源或配空壓機曝氣，產水帶壓，可以直接供水或上高位水箱，反洗可用高位水箱回水沖洗或配反洗泵抽清水反洗。自凈壓力式需有壓力氣源曝氣，出水帶壓，可直接供水，反洗不需配反洗泵，設備結構可以實現自產清水反洗。相同產水量設備價格高低順序為：重力式＜壓力式＜自凈壓力式。
地表水處理設備分A型（方型）、B型（圓型）、C型（臥式）三種。凈水器安裝位置高度受限時，可選用A型（方型），當高度不受限時采用B型（圓形）立式凈水器，因其價格相對低些。C型（臥式）為壓力式，產水帶壓，可上屋頂水箱、水塔、山上水池或直接供水，此種凈水器承壓，結構復雜，價格也貴一些。
需要殺菌消毒的，請選用二氧化氯發生器。
制備飲用純凈水、脫鹽水、去離子水、高純水、請選擇純水設備，制備飲用礦泉水、自來水深度凈化選擇超濾器，另外純水設備，超濾器還可以用于物料濃縮回收。
水源硬度高，易結水垢以及鍋爐水需軟化、除鹽處理的選用鈉離子軟化器及離子交換器，地下水含泥砂發黃，選用地下水除鐵錳設備。水中含氟量高選用地下水除氟設備。
游泳池水處理，循環水凈化處理選用循環水處理設備，需要過濾機械雜質，細小懸浮物可選用過濾器，處理污廢水請選用中水廢水設備。
