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??三格化糞池由相連的三個池子組成，中間由過糞管聯通。

??新鮮糞便由進糞口進入第一池，池內糞便開始發酵分解、比重不同糞液可自然分為三層，上層為糊狀糞皮，下層為塊狀或顆狀糞渣，中層為比較澄清的糞液。在上層糞皮和下層糞渣中細菌和寄生蟲卵最多，中層蟲卵最少，初步發酵的中層糞液經過糞管溢流至第二池，將大部分未經充分發酵的糞皮和糞渣阻留在第一池內繼續發酵。

??流入第二池的糞液進一步發酵分解，蟲卵繼續下沉，病原體逐漸死亡，糞液得到進一步無害化，產生的糞皮和糞厚度比第一池顯著減少。

??流入第三池的糞液一般已經腐熟，其中病菌和寄生蟲卵已基本殺滅。