廈（門）深（圳）鐵路作為《中長期鐵路網規劃》“四縱四橫”快速鐵路通道中杭州至深圳沿海快速鐵路通道的重要組成部分，東端引入廈門地區，并與既有鷹廈鐵路、福廈鐵路、向莆鐵路、龍廈鐵路相連；西端引入深圳地區，連接既有廣深鐵路、廣深港客運專線，并通過廣州樞紐與京廣鐵路通道與既有京九、廣茂等鐵路干線連通，將成為長三角、珠三角、閩粵、港澳、西南等地區間客貨交流的重要紐帶，形成我國東南沿海地區骨干鐵路線。長三角、海峽西岸和珠三角是我國金融、貿易、制造業和交通中心，客貨需求旺盛。沿海鐵路通道將大大改善沿海地區的交通運輸條件，完善區域綜合運輸體系，促進區域經濟社會快速可持續發展。對于加快長三角地區、海峽西岸經濟區、粵東北地區與香港的經濟互動，充分發揮經濟輻射能力都有著積極作用。被喻為“特區之虹”的廈深鐵路，聯結了廈門、汕頭、深圳三個經濟特區，把珠江三角洲與海峽西岸經濟區連接起來，形成東南沿海3小時經濟圈，將對區域經濟的整合和優化產生深遠影響。