因此，實驗室的平面布局、空調通風系統設計、氣流控制等都是圍繞這個核心問題進行的。為避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行，即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。

                                                                                                                                             PCR實驗室需要的儀器設備
試劑準備區：冰箱、超凈臺、加樣器、混勻器、天平和離心機等。標本制備區：生物安全柜、加樣器、離心機、溫育儀、混勻器等。擴增區：核酸擴增儀、超凈臺、微量加樣器、離心機、可移動紫外燈、配備UPS電源。分析區：酶標儀、洗板機、加樣器和水浴箱等。

                                                                                                                                                   污染的預防與控制
PCR實驗室設計的核心問題是如何避免污染。常見的有以下幾種污染類型：擴增產物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標本間的污染。要避免污染，首先應是預防，而不是排除。