番茄莖基腐多在進入結果期時發病，僅危害莖基部。發病初期，莖基部皮層外部無明顯病變，而后莖基部皮層逐漸變為淡褐色至黑褐色，繞莖部一圈，病部失水變干縮。病部以上葉片變黃，萎蔫。后期葉片變為黃褐色，枯死多殘留在枝上不脫落。根部及根系不腐爛。

發病規律：該病系土傳病害，病菌以菌絲體和菌核隨病殘體在土壤中存活和越冬。近年山東秋季定植后后7-10天至第一穗果開花結果期普遍發病。定植后露地番茄遇到陰雨天氣，光照不足或溫差大，植株生長衰弱易發病，秋延后番茄、秋冬番茄或越冬大棚番茄和長季節、反季栽培的番茄發病重。

主要原因：一是定植前土壤未消毒或消毒不徹底。大棚內土壤連茬種植茄果類致使病菌在土壤中積累，一旦出現發病條件立刻發病。二是越冬大棚番茄定植期過早，苗期低溫過高，大水漫灌后，根系透氣性降低，病菌侵入植株莖基部而發病。三是植株生長勢弱，土傳病害的病菌有了可乘之機。

防治方法：青枯立克60-100倍+大蒜油1000倍+沃豐素600倍+有機硅2000倍噴霧或灌根。連噴2-3次，每次間隔2-3天。