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另外報告也強調，厭氧微生物種群的基礎研究是對上述兩項技術日后發展，以及對既有厭氧消化技術優化的關鍵助力因素。專家認為研發新技術實現厭氧微生物種群系統功能的實時監測是這方面研究的關鍵所在。厭氧氨氧化（主流短程脫氮）主流厭氧氨氧化脫氮工藝利用了氨氧化菌：OB和：nammox菌的協同作用，無需外界碳源，即可將氨氮轉化為氮氣，整個過程需要更少的氧氣，因此能減少因曝氣產生的能耗；另一方面由于亞硝態氮氧化菌（NOB菌）而減少的SRT也將有助提高系統單位體積的處理能力。
