該系統(tǒng)大致分為控制單元（PXI（RT）系統(tǒng)）和操作單元（市售PC）。
控制單元主要將刺激呈現(xiàn)指令信號輸出到刺激呈現(xiàn)系統(tǒng)（VSG），將大腦測量指令信號輸出到大腦測量系統(tǒng)（MRI / MEG），與此同時，開關(guān)輸入信息（數(shù)字數(shù)據(jù)） ），然后輸入外部測量儀器（心電圖，呼吸，皮膚血流量）。另外，操作單元主要將設(shè)置文件發(fā)送到控制單元，監(jiān)視執(zhí)行狀態(tài)，并開始/結(jié)束（中斷）測量。