CK系列電子除垢儀處于工作狀態時，水流由進水口進入儀器內部，在高頻電磁場作用下，改變水的團鏈大分子結構，水分子的電子處于高能狀態，導致水分子電子電位下降，使水中鹽類離子及帶電粒子間靜電引力減弱，難以相聚集。水分子與器壁間電位差減少，各鹽類離子趨于分散，不向器壁聚集。形成電磁極化水，這種水流經受熱體時，形成針狀結晶，成為松軟，沙狀軟垢 ，便于沉淀，不易板結于受熱面，可隨水流動，通過排污渠道順利排出，防止新垢產生。電磁極化水滲透性和偶極距增大可浸潤老垢，使之龜裂，脫落，可除去老垢。 

此外，電磁極化水還可以有效的殺滅水中的菌類、藻類等，有效的抑制水中的微生物的繁殖。因器壁金屬離解受到抑制，對無垢系統具有防腐作用。